2023
Holík J.: Časoprostorové vzory zmlazení v přírodních temperátních lesích
Disertační práce (vedoucí práce: (Janik D.)
2021
Krůček M.: Popis porostní struktury přirozeného lesa pomocí pozemního a bezpilotního laserového skenování - kvantifikace korun ve 3D prostoru
Disertační práce (vedoucí práce: Král K.)
Daněk P.: Interakce mezi stromy a půdou v přirozených temperátních lesích v prostoru a čase
Disertační práce (vedoucí práce Šamonil P.)
Srubková A.: Ležící kmeny Picea abies (L.) Karst v horské lesnaté krajině: délka dekompozice a role v dynamice ekosystému
Diplomová práce (vedoucí práce Šamonil P.)
Püntener D.: Soil Erosion and Age Determination of Soils in a Forest-steppe Ecosystem in Cluj-Napoca, Romania
Diplomová práce (vedoucí práce Šamonil P., Egli M.)
2020
Rousová A.: Role extrémních větrných a biotických disturbancí v dynamice svahů horských temperátních pralesů
Diplomová práce (vedoucí práce Šamonil P.)
2018
Táborská M.: Diversity and ecology of epiphytic bryophyte communities on dead wood in forest nature reserves
Disertační práce (vedoucí práce Ódor P.)
Špinková T.: Role jednotlivých stromů při formování ekologických nik pro živočišnou složku lesních ekosystémů
Bakalářská práce (vedoucí práce Šamonil P.)
Senecká A.: Biomechanické vlivy stromů na půdu v přirozených temperátních lesích
Bakalářská práce (vedoucí práce Šamonil P.)
Posker T.: Půdy pralesovitých reliktů na Šumavě pod vlivem přirozených a antropogenních disturbancí
Bakalářská práce (vedoucí práce Šamonil P.)
Paták O.: Dekompozice dřeva v horských temperátních lesích a jeho dopad na pedogenezi
Diplomová práce (vedoucí práce Šamonil P.)
2017
Holík J.: Přirozená obnova jedle bělokoré (Abies alba Mill.) v NPR Salajka
Diplomová práce (vedoucí práce: Hort L.)
Přívětivý T.: Dynamika rozkladu tlejícího dřeva v přirozených temperátních lesích
Disertační práce (vedoucí práce: Vrška T.)
Trochta J.: The use and processing of TLS data for purposes of forestry.
Disertační práce (vedoucí práce: Král K.)
2016
Škulavík J.: Disturbanční historie přirozených temperátních lesů: případová studie z Boubínského pralesa
Diplomová práce (vedoucí práce: Šamonil P.)
2014
Holík J.: Dynamika přirozené obnovy dřevin Západních Karpat se zaměřením na jedli bělokorou
Bakalářská práce (vedoucí práce: Hort L.)
Komárek J.: Interpolace digitálního modelu povrchu korun pro analýzu porostních mezer přírodního smrko-jedlo-bukového lesa.
Diplomová práce (vedoucí práce: Král K.)
Komárková E.: Dynamika přirozené obnovy dřevin v NPR Boubínský prales.
Diplomová práce (vedoucí práce: Hort L.)
Krůček M.: Sledování sukcese dřevin po požáru s využitím leteckých snímků na lokalitě Havraní skála v NP České Švýcarsko.
Diplomová práce (vedoucí práce: Král K.)
Palán R.: Změny dřevinného patra v NPR Mionší.
Diplomová práce (vedoucí práce: Hort L.)
Pavlicová P.: Přestavby jehličnatých porostů na smíšené listnaté v NP Podyjí - případová studie objektu Pyramida v období 1992-2013
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
2013
Hrnčíř D.: Dynamika přirozené obnovy v NPR Ranšpurk
Diplomová práce (vedoucí práce: Hort L.)
Janík D.: Prostorová distribuce dominantních druhů dřevin ve vybraných přirozených lesích ČR
Disertační práce (školitel: Král K.)
Přívětivý T.: Dynamika obnovy jedle a buku v Západních Karpatech (Mionší, Razula, Salajka)
Diplomová práce (vedoucí práce: Hort L.)
Šumpichová R.: Sekundární sukcese jako nástroj obnovního managementu lesů v NP Podyjí
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
Tureček F.: Dynamika přirozené obnovy v NPR Cahnov-Soutok
Diplomová práce (vedoucí práce: Hort L.)
Unar P.: Role dřevinného patra na vývoji bylinného podrostu přirozených temperátních lesů v ČR.
Disertační práce (školitel: Šamonil P.)
Valtera M.: Vliv disturbančního režimu přirozeného temperátního lesa na variabilitu půd na různých prostorových úrovních.
Disertační práce (školitel: Šamonil P.)
2012
Komárková E.: Vývoj a struktura přirozeného zmlazení v NPR Boubínský prales.
Bakalářská práce (vedoucí práce: Hort L.)
Pícha J.: Expanze buku v NPR Žofínský prales v období 1847-2011
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
Soukup I.: Záchrana populace jedle bělokoré Abies alba (Mill.) v NP Podyjí - dosavadní výsledky za období 1995-2010 a návrh dokončení programu
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
2011
Pícha J.: Historický vývoj dřevinné skladby Žofínského pralesa
Bakalářská práce (vedoucí práce: Vrška T.)
Hrnčíř D.: Vývoj a struktura přirozeného zmlazení v NPR Ranšpurk
Bakalářská práce (vedoucí práce: Hort L.)
Tureček F.: Vývoj a struktura přirozeného zmlazení v NPR Cahnov-Soutok
Bakalářská práce (vedoucí práce: Hort L.)
Šebková B.: Význam disturbancí v přirozených lesích s převahou Fagus sylvatica
Disertační práce (školitel: Šamonil P.)
2010
Vrška T.: Dynamika a management přirozených lesů v České republice
Habilitační práce
Trochta J. : Defoliace korun lesního porostu vlivem požáru na lokalitě Havraní skála v NP České Švýcarsko
Diplomová práce (vedoucí práce: Král K.)
Ehrenbergerová L.: Jaká existuje podobnost v dynamice přirozených temperátních lesů severní a jižní polokoule? - případová studie porostů s dominancí Fagus sylvatica L.(Česká republika) a Nothofagus spp. (Chile)
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
2009
Valtera M.: Plošná charakteristika půdních vlastností v přirozeně disturbovaném smrko-jedlo-bukovém (pra)lese
Diplomová práce (vedoucí práce: Šamonil P.)
Tkadlec V.: Dynamika dřevinného patra NPR Salajka v letech 1974-2007 se zvláštním zřetelem k populaci Abies alba (Mill.)
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
Chalupa J.: Analýza současné populace borovice blatky (Pinus rotundata Link.) v PR Borkovická blata a návrh managementu PR s cílem záchrany populace
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
Pálková M.: Regenerace smrkojedlobukového (pra)lesa ve vazbě k přirozeným disturbancím a ke stanovišti
Diplomová práce (vedoucí práce: Šamonil P.)
Jurek V.: Sukcese dřevin po požáru na lokalitě Havraní skála v NP České Švýcarsko (výchozí stav)
Diplomová práce (vedoucí práce: Král K.)
2008
Růžička P.: Obnovní management lesů v NP Podyjí na stanovištích 2. a 3. LVS
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
2007
Chmelař J.: Struktura dřeviného patra v PR Holý kopec
Diplomová práce (vedoucí práce: Hort L.)
2006
Konečný P.: Biodiverzita dřevních hub na příkladu NPR Ranšpurk ve vztahu k tlejícímu dřevu
Diplomová práce (vedoucí práce: Hort L.)
2005
Král K.: Hodnocení a mapování lesních a křovinných geobiocenóz s využitím geoinformačních metod
Disertační práce (školitel: doc.Ing. Antonín Buček, CSc.)
Fňukalová M.: Vývojová dynamika porostů v PR Roštýnská obora
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
Duda T.: Dynamika vývoje synuzie dřevin v NPR Mionší
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
2001
Odehnalová P.: Dynamika lesních společenstev v přírodní rezervaci V Klučí
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
2000
Valenta J.: Inventarizace a taxonomické zhodnocení dřevin v NPR Cahnov-Soutok
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
Obrdlík V.: Inventarizace a taxonomické zhodnocení dřevin v NPR Ranšpurk
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
1999
Král K.: Lesní geobiocenózy lokality Ledové sluje v NP Podyjí
Diplomová práce (vedoucí práce: Vrška T.)
1997
Vrška T.: Sledování dynamiky vývoje pralesovitých rezervací ČR na příkladě rezervací Cahnov-Soutok a Diana
Disertační práce (školitel: doc. Ing. Antonín Buček, CSc.)
